🦠 Antimicrobial Resistance Predictor
По последовательности гена-мишени (GyrA, RpoB, PBP, 16S rRNA) предсказываем резистентность к классам антибиотиков. Rule-based поиск известных мутаций (CARD/ResFinder) + motif search для резистентных генов (blaTEM, ermB, tetM...).
Образцы
Последовательность гена-мишени
Длина: 215 симв.
0
Overall resistance score
Чувствителен
Найдено хитов: 0 • генов резистентности: 0
По классам антибиотиков
✅ Классы с известной резистентностью не обнаружены
📋 Рекомендация
Известных детерминант резистентности не обнаружено. Препараты из всех классов могут быть эффективны. Важно: отрицательный результат не гарантирует чувствительность — возможны механизмы, не входящие в базу.
Алгоритм:
• Rule-based поиск известных мутаций (CARD/ResFinder subset) — для GyrA, RpoB, PBP, 23S rRNA, FolP.
• Motif search для резистентных генов: blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, tetM, ermB, aac(3)-IV, qnrA.
• Confidence 75-95% для каноничных мутаций.
⚠️ Упрощённая база (~10 генов + ~7 motifs). Реальная AMR-прогнозизация требует WGS + CARD/ResFinder + фенотипическую валидацию.
• Rule-based поиск известных мутаций (CARD/ResFinder subset) — для GyrA, RpoB, PBP, 23S rRNA, FolP.
• Motif search для резистентных генов: blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, tetM, ermB, aac(3)-IV, qnrA.
• Confidence 75-95% для каноничных мутаций.
⚠️ Упрощённая база (~10 генов + ~7 motifs). Реальная AMR-прогнозизация требует WGS + CARD/ResFinder + фенотипическую валидацию.